Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2HP62256 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2HP62256 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms