Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN5P54829 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN5P54829 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.6 ms