Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMS1P54277 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMS1P54277 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS1P54277 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS1P54277 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS1P54277 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS1P54277 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS1P54277 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMS1P54277 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMS1P54277 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMS1P54277 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMS1P54277 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMS1P54277 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMS1P54277 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMS1P54277 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS1P54277 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS1P54277 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS1P54277 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS1P54277 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS1P54277 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMS1P54277 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS1P54277 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS1P54277 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS1P54277 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMS1P54277 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMS1P54277 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMS1P54277 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMS1P54277 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMS1P54277 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMS1P54277 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMS1P54277 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMS1P54277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMS1P54277 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMS1P54277 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMS1P54277 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PMS1P54277 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMS1P54277 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PMS1P54277 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms