Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP2P46087 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP2P46087 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP2P46087 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP2P46087 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP2P46087 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP2P46087 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP2P46087 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP2P46087 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP2P46087 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP2P46087 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP2P46087 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP2P46087 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP2P46087 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP2P46087 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOP2P46087 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOP2P46087 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP2P46087 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOP2P46087 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOP2P46087 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP2P46087 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP2P46087 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NOP2P46087 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP2P46087 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP2P46087 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOP2P46087 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP2P46087 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP2P46087 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP2P46087 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP2P46087 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP2P46087 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP2P46087 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP2P46087 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP2P46087 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP2P46087 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP2P46087 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP2P46087 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP2P46087 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP2P46087 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP2P46087 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP2P46087 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOP2P46087 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms