Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YTA6YPL074W 2265 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 TRK2YKR050W 2670 nt5.06□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.06□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YHL018WYHL018W 363 nt5.06□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YLR463CYLR463C 552 nt5.06□□□□□ -1.6
DDI1P40087 CCZ1YBR131W 2115 nt5.06□□□□□ -1.6
DDI1P40087 UBP9YER098W 2265 nt5.06□□□□□ -1.6
DDI1P40087 EEB1YPL095C 1371 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 BIT2YBR270C 1638 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YDR541CYDR541C 1035 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 RRP4YHR069C 1080 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 DOT5YIL010W 648 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 REV7YIL139C 738 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 PDR16YNL231C 1056 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 HRP1YOL123W 1605 nt5.05□□□□□ -1.6
DDI1P40087 SKS1YPL026C 1509 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 NSI1YDR026C 1713 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YEA6YEL006W 1008 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 MND2YIR025W 1107 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 HOS1YPR068C 1413 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 VAN1YML115C 1608 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 DAK1YML070W 1755 nt5.04□□□□□ -1.6
DDI1P40087 FOB1YDR110W 1701 nt5.03□□□□□ -1.6
DDI1P40087 NOP2YNL061W 1857 nt5.03□□□□□ -1.6
DDI1P40087 PEX32YBR168W 1242 nt5.03□□□□□ -1.6
DDI1P40087 PSE1YMR308C 3270 nt5.03□□□□□ -1.6
DDI1P40087 PDI1YCL043C 1569 nt5.03□□□□□ -1.6
DDI1P40087 UGO1YDR470C 1509 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 ACF2YLR144C 2340 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 NPL6YMR091C 1308 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 CTR3YLR411W 726 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 LEM3YNL323W 1245 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 GLT1YDL171C 6438 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 RAT1YOR048C 3021 nt5.02□□□□□ -1.61
DDI1P40087 BPL1YDL141W 2073 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 MET7YOR241W 1647 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 NGR1YBR212W 2019 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 ASK10YGR097W 3441 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 PEX19YDL065C 1029 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YER084WYER084W 387 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 RPR2YIR015W 435 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YPR195CYPR195C 330 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 APM2YHL019C 1818 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 ATG23YLR431C 1362 nt5.01□□□□□ -1.61
DDI1P40087 CDC4YFL009W 2340 nt5□□□□□ -1.61
DDI1P40087 ECT1YGR007W 972 nt5□□□□□ -1.61
DDI1P40087 REC114YMR133W 1287 nt5□□□□□ -1.61
DDI1P40087 DCI1YOR180C 816 nt5□□□□□ -1.61
DDI1P40087 STE50YCL032W 1041 nt5□□□□□ -1.61
DDI1P40087 SLT2YHR030C 1455 nt5□□□□□ -1.61
DDI1P40087 RIM15YFL033C 5313 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 SEC39YLR440C 2130 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YCL065WYCL065W 369 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 SFK1YKL051W 1062 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 AAD15YOL165C 432 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 QDR1YIL120W 1692 nt4.99□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YOR1YGR281W 4434 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 QRI1YDL103C 1434 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YRA1YDR381W 681 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YJL107CYJL107C 1164 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 ATG17YLR423C 1254 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YML018CYML018C 1182 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 AVO2YMR068W 1281 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 TOS3YGL179C 1683 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 HXT5YHR096C 1779 nt4.98□□□□□ -1.61
DDI1P40087 CNM67YNL225C 1746 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 PPR1YLR014C 2715 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 DED81YHR019C 1665 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 AAD4YDL243C 990 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 PGA3YML125C 939 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 GPM3YOL056W 912 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 SLD7YOR060C 774 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 KIP2YPL155C 2121 nt4.97□□□□□ -1.61
DDI1P40087 SED4YCR067C 3198 nt4.96□□□□□ -1.61
DDI1P40087 SPC97YHR172W 2472 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 COR1YBL045C 1374 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 XPT1YJR133W 630 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 RPS19BYNL302C 435 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SOL1YNR034W 966 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 UBC4YBR082C 447 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 STE20YHL007C 2820 nt4.96□□□□□ -1.62
DDI1P40087 PRE3YJL001W 648 nt4.95□□□□□ -1.62
DDI1P40087 HLJ1YMR161W 675 nt4.95□□□□□ -1.62
DDI1P40087 RPA49YNL248C 1248 nt4.95□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YNR048WYNR048W 1182 nt4.95□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YOR024WYOR024W 324 nt4.95□□□□□ -1.62
DDI1P40087 MGS1YNL218W 1764 nt4.95□□□□□ -1.62
DDI1P40087 PUS1YPL212C 1635 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 PAL1YDR348C 1500 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 PRP43YGL120C 2304 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YGR125WYGR125W 3111 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 DPB2YPR175W 2070 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YJL211CYJL211C 444 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SCO1YBR037C 888 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 ATG12YBR217W 561 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 ORC5YNL261W 1440 nt4.94□□□□□ -1.62
DDI1P40087 CTS2YDR371W 1536 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 CTS1YLR286C 1689 nt4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms