Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.36	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.36	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	GCS1	YDL226C	1059 nt		5.36	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	PRP45	YAL032C	1140 nt		5.36	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		5.36	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	IES1	YFL013C	2079 nt		5.35	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	LSG1	YGL099W	1923 nt		5.35	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	NMT1	YLR195C	1368 nt		5.35	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	TRP5	YGL026C	2124 nt		5.35	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	FOL1	YNL256W	2475 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	SUA5	YGL169W	1281 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	MRPL4	YLR439W	960 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	ROX3	YBL093C	663 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	GPM3	YOL056W	912 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	SER1	YOR184W	1188 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	HST2	YPL015C	1074 nt		5.34	□□□□□ -1.55
ATG12	P38316	YFL034W	YFL034W	3222 nt		5.34	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	BRF1	YGR246C	1791 nt		5.34	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	HSP104	YLL026W	2727 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	UTR4	YEL038W	684 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	SPG4	YMR107W	348 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	EMW1	YNL313C	2715 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	QDR1	YIL120W	1692 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	MSN2	YMR037C	2115 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.33	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	SIA1	YOR137C	1869 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	QRI1	YDL103C	1434 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	VTH1	YIL173W	4650 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	VTH2	YJL222W	4650 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	COT1	YOR316C	1320 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	YDR134C	YDR134C	411 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	BUD28	YLR062C	378 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	LEM3	YNL323W	1245 nt		5.32	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	HXT15	YDL245C	1704 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	HXT16	YJR158W	1704 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	LCP5	YER127W	1074 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	PRE7	YBL041W	726 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	RPS19B	YNL302C	435 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	IRS4	YKR019C	1848 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	DBP9	YLR276C	1785 nt		5.31	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	KDX1	YKL161C	1302 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	ALT2	YDR111C	1524 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	MTW1	YAL034W-A	870 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	OST3	YOR085W	1053 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	MRL1	YPR079W	1146 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	COQ6	YGR255C	1440 nt		5.3	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.29	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	YPT32	YGL210W	669 nt		5.29	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	STE50	YCL032W	1041 nt		5.29	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	DAK1	YML070W	1755 nt		5.29	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	SSY5	YJL156C	2100 nt		5.29	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	RPB4	YJL140W	666 nt		5.28	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	YTH1	YPR107C	627 nt		5.28	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	YMR027W	YMR027W	1413 nt		5.28	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	TUB2	YFL037W	1374 nt		5.28	□□□□□ -1.56
ATG12	P38316	DEF1	YKL054C	2217 nt		5.27	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	TFB4	YPR056W	1017 nt		5.27	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	KIP2	YPL155C	2121 nt		5.27	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	EEB1	YPL095C	1371 nt		5.27	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	FET3	YMR058W	1911 nt		5.27	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YDR401W	YDR401W	564 nt		5.26	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		5.26	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	JAC1	YGL018C	555 nt		5.26	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YOR024W	YOR024W	324 nt		5.26	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	SCO1	YBR037C	888 nt		5.26	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	MSS1	YMR023C	1581 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	APJ1	YNL077W	1587 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	SKG1	YKR100C	1068 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	PUS5	YLR165C	765 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	CKB2	YOR039W	777 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	BPL1	YDL141W	2073 nt		5.25	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	NOT3	YIL038C	2511 nt		5.24	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YDL023C	YDL023C	321 nt		5.24	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	ECM15	YBL001C	315 nt		5.24	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	RPA49	YNL248C	1248 nt		5.24	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	HXT17	YNR072W	1695 nt		5.24	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	ATG20	YDL113C	1923 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	GAL10	YBR019C	2100 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	SPT3	YDR392W	1014 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	ARO2	YGL148W	1131 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YJL107C	YJL107C	1164 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YLR296W	YLR296W	327 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	ATG33	YLR356W	594 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YIR007W	YIR007W	2295 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	MSH1	YHR120W	2880 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	YIL067C	YIL067C	2037 nt		5.23	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	AVT3	YKL146W	2079 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	CTS1	YLR286C	1689 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	RPN12	YFR052W	825 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	MPM1	YJL066C	759 nt		5.22	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 76.8 ms