Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT2P35908 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT2P35908 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT2P35908 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT2P35908 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT2P35908 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT2P35908 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT2P35908 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT2P35908 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT2P35908 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT2P35908 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT2P35908 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT2P35908 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT2P35908 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT2P35908 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT2P35908 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT2P35908 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT2P35908 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT2P35908 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT2P35908 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT2P35908 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT2P35908 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT2P35908 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT2P35908 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT2P35908 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT2P35908 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT2P35908 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT2P35908 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT2P35908 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT2P35908 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT2P35908 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT2P35908 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT2P35908 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT2P35908 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT2P35908 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT2P35908 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 364.4 ms