Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHMT2P34897 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHMT2P34897 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHMT2P34897 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms