Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLNP26678 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLNP26678 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLNP26678 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLNP26678 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PLNP26678 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLNP26678 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLNP26678 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLNP26678 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLNP26678 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLNP26678 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLNP26678 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLNP26678 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLNP26678 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms