Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3P19429 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms