Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF28P17035 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms