Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCL8P10145 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL8P10145 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL8P10145 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms