Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-30-3P0DP02 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV3-30-3P0DP02 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms