Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPH10BP0C881 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RSPH10BP0C881 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH10BP0C881 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms