Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA3P0C7M3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms