Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APODP05090 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APODP05090 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APODP05090 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APODP05090 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APODP05090 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APODP05090 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APODP05090 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APODP05090 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APODP05090 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APODP05090 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APODP05090 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APODP05090 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APODP05090 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APODP05090 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APODP05090 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APODP05090 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APODP05090 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APODP05090 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APODP05090 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APODP05090 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APODP05090 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APODP05090 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APODP05090 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APODP05090 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APODP05090 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APODP05090 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APODP05090 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APODP05090 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APODP05090 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APODP05090 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APODP05090 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APODP05090 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APODP05090 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APODP05090 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APODP05090 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms