Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN2P04844 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPN2P04844 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPN2P04844 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPN2P04844 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPN2P04844 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPN2P04844 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPN2P04844 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPN2P04844 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPN2P04844 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPN2P04844 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPN2P04844 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPN2P04844 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPN2P04844 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPN2P04844 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPN2P04844 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPN2P04844 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPN2P04844 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPN2P04844 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPN2P04844 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPN2P04844 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPN2P04844 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPN2P04844 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPN2P04844 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPN2P04844 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPN2P04844 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPN2P04844 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPN2P04844 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPN2P04844 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPN2P04844 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPN2P04844 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPN2P04844 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPN2P04844 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPN2P04844 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPN2P04844 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226 ms