Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFPP02771 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFPP02771 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFPP02771 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFPP02771 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AFPP02771 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AFPP02771 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFPP02771 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFPP02771 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFPP02771 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFPP02771 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFPP02771 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFPP02771 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFPP02771 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFPP02771 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFPP02771 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFPP02771 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFPP02771 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFPP02771 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFPP02771 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFPP02771 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFPP02771 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFPP02771 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AFPP02771 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFPP02771 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFPP02771 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFPP02771 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFPP02771 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AFPP02771 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AFPP02771 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFPP02771 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFPP02771 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFPP02771 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFPP02771 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFPP02771 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFPP02771 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFPP02771 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFPP02771 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AFPP02771 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFPP02771 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFPP02771 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms