Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CILPO75339 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CILPO75339 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CILPO75339 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CILPO75339 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CILPO75339 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CILPO75339 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CILPO75339 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CILPO75339 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CILPO75339 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CILPO75339 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CILPO75339 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CILPO75339 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CILPO75339 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CILPO75339 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CILPO75339 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CILPO75339 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CILPO75339 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CILPO75339 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CILPO75339 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CILPO75339 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CILPO75339 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CILPO75339 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CILPO75339 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CILPO75339 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CILPO75339 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CILPO75339 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CILPO75339 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CILPO75339 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CILPO75339 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CILPO75339 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CILPO75339 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CILPO75339 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CILPO75339 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CILPO75339 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CILPO75339 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CILPO75339 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CILPO75339 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CILPO75339 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CILPO75339 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CILPO75339 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CILPO75339 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CILPO75339 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1305.7 ms