Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDF1O60869 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDF1O60869 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDF1O60869 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDF1O60869 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDF1O60869 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDF1O60869 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDF1O60869 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDF1O60869 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDF1O60869 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDF1O60869 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDF1O60869 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDF1O60869 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDF1O60869 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDF1O60869 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDF1O60869 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDF1O60869 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDF1O60869 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDF1O60869 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDF1O60869 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDF1O60869 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDF1O60869 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDF1O60869 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDF1O60869 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDF1O60869 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDF1O60869 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDF1O60869 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDF1O60869 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDF1O60869 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms