Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS11DO60235 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS11DO60235 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms