Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRTM2O43300 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRTM2O43300 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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