Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WNT9AO14904 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
WNT9AO14904 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WNT9AO14904 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT9AO14904 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms