Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB1P1B2RPK0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms