Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms