Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC160A6NGH7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms