Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCCD1A6NED2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms