Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COQ4Q9Y3A0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COQ4Q9Y3A0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms