Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A6Q9Y2P4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A6Q9Y2P4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A6Q9Y2P4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A6Q9Y2P4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A6Q9Y2P4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A6Q9Y2P4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A6Q9Y2P4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A6Q9Y2P4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A6Q9Y2P4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A6Q9Y2P4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A6Q9Y2P4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A6Q9Y2P4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A6Q9Y2P4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms