Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC55.48■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.48■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC55.47■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.47■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.46■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC55.46■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.46■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.46■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC55.45■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC55.45■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.45■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.45■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC55.44■■■■■ 6.47
NISCHQ9Y2I1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC55.43■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.43■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC55.42■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC55.42■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.42■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.42■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC55.41■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.4■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC55.39■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.39■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.38■■■■■ 6.46
NISCHQ9Y2I1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.37■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.37■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.37■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC55.37■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.37■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC55.33■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC55.33■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC55.33■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC55.32■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC55.31■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC55.31■■■■■ 6.45
NISCHQ9Y2I1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.31■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.3■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC55.3■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC55.3■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.29■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC55.29■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.29■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.28■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.27■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.27■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC55.26■■■■■ 6.44
NISCHQ9Y2I1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC55.25■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.23■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.23■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.22■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.22■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC55.21■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC55.2■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.2■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC55.19■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.19■■■■■ 6.43
NISCHQ9Y2I1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC55.18■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.18■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC55.17■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC55.17■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.16■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC55.16■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC55.16■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.15■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.15■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC55.15■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC55.15■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC55.14■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.14■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC55.13■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
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