Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS5Q9UPZ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 740.4 ms