Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AKAP11Q9UKA4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
AKAP11Q9UKA4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AKAP11Q9UKA4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AKAP11Q9UKA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP11Q9UKA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AKAP11Q9UKA4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms