Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNPLA3Q9NST1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms