Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMYD2Q9NRG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD2Q9NRG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD2Q9NRG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms