Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms