Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAMQ9HCL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAMQ9HCL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAMQ9HCL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAMQ9HCL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAMQ9HCL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAMQ9HCL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAMQ9HCL2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms