Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ROBO2Q9HCK4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ROBO2Q9HCK4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ROBO2Q9HCK4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ROBO2Q9HCK4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms