Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOBEC3GQ9HC16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3GQ9HC16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3GQ9HC16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms