Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSS3Q9H6R3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms