Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSUN3Q9H649 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSUN3Q9H649 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NSUN3Q9H649 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN3Q9H649 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms