Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCX3BQ9H321 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCX3BQ9H321 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms