Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSDMCQ9BYG8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMCQ9BYG8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms