Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS2Q9BXC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS2Q9BXC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS2Q9BXC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms