Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC2P3Q9BVR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC2P3Q9BVR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms