Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSG1Q9BU20 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RSG1Q9BU20 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RSG1Q9BU20 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms