Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MESP1Q9BRJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms