Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH2D3AQ9BRG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D3AQ9BRG2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D3AQ9BRG2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH2D3AQ9BRG2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms