Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3CQ99985 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3CQ99985 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms