Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN2Q99700 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms