Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC35A4Q96G79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC35A4Q96G79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms